مدیریت تدریسی پوهنحی طب، تحت نظر معاونیت امور محصلان فعالیت نموده و مسئولیت تنظیم و مدیریت امور تدریسی و سیستم مدیریتی سیب را بر عهده دارد. این مدیریت شامل ثبت‌نام محصلان، انتخاب واحد، تهیه حاضری، ثبت برنامه‌های درسی و امتحانی، ترتیب و اصلاح نتایج، تهیه کتاب فارغان و ارائه گزارش‌ها می‌باشد. همچنین با بخش‌های مختلف پوهنتون در راستای بهبود کیفیت آموزش و هماهنگی امور تدریسی همکاری مستمر دارد.