مدیریت تدریسی پوهنحی طب، تحت نظر معاونیت امور محصلان فعالیت نموده و مسئولیت مدیریت امور تدریسی را بر عهده دارد. از مهم‌ترین وظایف این مدیریت می‌توان به ثبت‌نام محصلان جدیدالشمول، تنظیم و تسهیل روند انتخاب واحد، تهیه حاضری‌های درسی، ثبت برنامه‌های درسی و امتحانی در سیستم معلوماتی«سیب»، ترتیب، ثبت و اصلاح نتایج امتحانات، تهیه کتاب فارغان و تنظیم و ارائه گزارش‌های تدریسی اشاره نمود. این مدیریت در راستای ارتقای کیفیت آموزشی، تسهیل امور اکادمیک و ایجاد هماهنگی مؤثر میان واحدهای ذی‌ربط، با بخش‌های مختلف پوهنتون همکاری مستمر دارد.