از نگاه ساختاری، مدیریت دفتر به ‌صورت مستقیم تحت مجموعه معاونت علمی تعریف گردیده و مسئول تنظیم و انسجام آرشیف‌های معاونت علمی، ثبت و پی­گیری مصوبات جلسات معاونت، ارائه آن به معاون علمی و همچنان پی­گیری امور مربوط به بخش تضمین کیفیت می‌باشد.