به‌ منظور تحقق اهداف پوهنتون، معاونت اداری و مالی مسئول ایجاد یک سیستم منظم اداری، نظارت بر تطبیق دقیق قوانین و مقررات اداری و مالی، و همچنان فراهم‌ سازی زمینه ‌های لازم برای دستیابی به اهداف پوهنتون و نظام تحصیلات عالی می‌باشد. این بست، به‌ عنوان یک معاونت استراتیژیک در ساختار پوهنتون، نقش رهنمایی و حمایتی را برای بخش‌های مختلف ایفا نموده و در راستای تحقق اهداف اساسی، از ادارات ذی‌ربط به‌گونه مؤثر حمایت و هماهنگی لازم را فراهم می‌نماید.