ریاست دفتر رئیس پوهنتون به‌عنوان یکی از واحدهای کلیدی و هماهنگ‌کننده در ساختار اداری پوهنتون، مسئولیت تنظیم، مدیریت و پی‌گیری کلیه امور مرتبط با دفتر ریاست را بر عهده دارد. این ریاست نقش مهمی در برقراری ارتباط مؤثر میان ریاست پوهنتون و بخش‌های مختلف اداری، علمی و اجرایی ایفا می‌نماید. تنظیم جلسات، مدیریت مکاتبات رسمی، پی‌گیری مصوبات، هماهنگی برنامه‌های کاری و تضمین اجرای به‌موقع تصمیمات از وظایف اساسی این بخش به‌شمار می‌رود. این ریاست با رعایت اصول شفافیت، دقت، نظم اداری و محرمانگی، زمینه تسهیل روند امور و ارتقای کارایی در سطح پوهنتون را فراهم می‌سازد.