دانشگاه خاتم النبیین(ص) توسط فقیه نواندیش و مجاهد حضرت آیت الله العظمی محسنی(ره) و با همت و همکاری صاحب امتیازان آن هر یک دکتر عبدالقیوم سجادی نماینده فعال مردم در شورای ملی و الحاج محمد جواد محسنی و تلاش های جمعی از فرهیختگان در سال ۱۳۸۶ در پایتخت کشور اساس گذاشته شد. شعبه غزنی این دانشگاه با توجه به تشخیص ضرورت این مرکز اکادمیک و علمی در این ولایت توسط دکترسجادی، دانشمند فرهیخته و نماینده فعال مردم ولایت غزنی در پارلمان، و با حمایت های بیدریغ الحاج محمد جواد محسنی صاحبامتیاز ارشد دانشگاه، در سال ۱۳۹۱ در شهر باستانی غزنی بنیان گذاشته شد.
این دانشگاه با حدود یک و نیم دهه فعالیت علمی و اکادمیک در پایتخت کشور و یک دهه فعالیت در غزنی، در جمع بهترین و معیاری ترین دانشگاه های خصوصی کشور قرار دارد. صاحبامتیازان ارزشمدار و رهبریت اخلاقمحور و ملیگرای این مرکز علمی و اکادمیک، شعار این دانشگاه را تعهد دینی و تخصص علمی تعریف نموده اند؛ شعاری که همواره در فعالیت های علمی، پژوهشی، فرهنگی و اجتماعی دانشگاه خاتم النبیین ملاک عمل برای دستاندرکاران آن بوده است.