معاونت امور محصلان یکی از معاونتهای سهگانهی تعریف شده در ساختار تشکیلاتی پوهنتون بوده که مسئولیت پیشبرد پروسهی جذب محصلان، زمینهسازی ارتقای ظرفیت محصلین، ایجاد حفظ و تقویت ارتباط میان دانشگاه و دانشجویان، حفظ و نگهداری اسناد مرتبط با محصلین و صدور و طی مراحل اسناد تحصیلی را به عهده دارد.معاونت امور محصلان پوهنتون خاتمالنبیین(ص) با در نظرداشت صلاحیت و مسئولیت خویش در راستای ارائهی خدمات موثر برای دانشجویان تلاش خواهد کرد و در راستای سیاستهای کلان دانشگاه و تحقق شعار «تعهد و تخصص» گامهای موثر را بردارد.